Le dispositif de surveillance de la diphtérie mis en place par Santé publique France permet d’étudier les tendances épidémiologiques de cette maladie à prévention vaccinale ainsi que sa couverture vaccinale.

Données épidémiologiques de la diphtérie en France

En 2025 en France, 39 cas de diphtérie tox+ sont survenus et ont été rapportés :

• 14 cas de diphtérie à C. diphtheriae en France hexagonale (10 formes cutanées, 3 formes ORL, 1 forme non renseignée)
• 7 cas de diphtérie à C. diphtheriae à Mayotte (5 formes cutanée, 2 formes ORL) et 1 cas de diphtérie à C. diphtheriae cutanée en Guyane
• 17 cas de diphtérie à C. ulcerans en France hexagonale (14 formes cutanées, 2 formes ORL, 1 hémoculture)

Par ailleurs, en France hexagonale, un cas clinique (forme ORL) avec un lien épidémiologique identifié lors de l’enquête autour d’un cas a été déclaré. A Mayotte 4 cas porteurs de C.diphtheriae sans que soit confirmé le caractère tox+ de la bactérie, avec un lien épidémiologique identifié lors de l’enquête autour d’un cas, ont également été signalés.

En France hexagonale, parmi les 14 cas de diphtérie à C. diphtheriae rapportés, 5 étaient des voyageurs de retour d’un pays Africain (ou personne en lien avec un voyageur), 2 sont des migrants arrivés récemment en France et 7 sont des personnes pour lesquelles l’investigation n’a pas mis en évidence de lien avec un voyage ou un séjour à l’étranger. Huit d’entre elles résidaient en Ile-de-France. Parmi celles-ci, deux cas confirmés (ainsi que le cas clinique) appartenaient à un même cluster, associé à un retour de Mauritanie. Cinq des autres cas franciliens étaient sans domicile fixe (3 cas) ou toxicomanes (2 cas). Parmi les 14 cas de diphtérie à C. diphtheriae 3 étaient âgées de moins de 18 ans.

Les analyses de séquençage du Centre National de Référence des corynébactéries du complexe diphtheriae ont montré que les souches de 4 des 8 cas d’Ile-de-France, qui n’avaient pas voyagé, appartenaient au même cluster génétique, l’un des clusters principaux de l’épidémie survenue chez les migrants en 2022-2023. Ces souches étaient très proches génétiquement, avec 2 à 5 différences alléliques à l’échelle génomique. Cette proximité génétique est compatible avec une transmission très récente et en faveur d'une circulation de la bactérie dans cette région en particulier parmi les personnes en situation de précarité bien qu’un des cas concernés n’appartenait pas à ce groupe. A noter que des souches issues du même cluster avaient déjà été retrouvées en 2024, chez 5 patients dont 4 résidaient en Ile-de-France et 1 dans la région Provence-Alpes-Côte d’Azur.

Par ailleurs, les souches de deux patients migrants, l’un signalé dans la région Grand Est en mars 2025 et l’autre signalé dans la région Provence-Alpes-Côte d’Azur en décembre 2025 partageaient un génotype identique. L’investigation épidémiologique n’a cependant révélé aucun lieu commun ou exposition identique pour ces deux patients. 

L’année 2022 avait été marquée par une forte augmentation du nombre de cas de diphtérie à C. diphtheriae rapportés en France hexagonale. La majorité de ces cas étaient des personnes migrantes. Cette augmentation s’était poursuivie au premier trimestre de l’année 2023 pour diminuer ensuite. En 2025, le nombre de cas de diphtérie à C. diphtheriae était plus élevé que la moyenne annuelle observée sur la période 2017-2021 (3,4 cas) mais il était plus faible qu’en 2022 (35 cas), 2023 (18 cas) et 2024 (15 cas).

En outre-mer, à Mayotte 2 cas et 4 cas porteurs de C.diphtheriae, des enfants, appartenaient à un même cluster survenu dans une école. Cinq d’entre eux ont été diagnostiqués suite à la recherche de cas et au dépistage organisés dans l’entourage du cas index. En Guyane le cas était âgé de 15 ans.

Les cas de diphtérie à C. ulcerans étaient tous des adultes et au moins 14 d’entre eux avaient eu un contact avec un animal (chien et/ou chat).

Nombre de cas annuels de diphtérie par espèces de Corynebacterium déclarés en France de 1989 à 2025, source : déclaration obligatoire-Santé publique France