Recensement national des cas de COVID-19 chez les professionnels en établissements de santé

Depuis le 22 avril 2020, Santé publique France en lien avec le GERES et avec l’appui des CPIAS a mis en place une surveillance afin de recenser les professionnels exerçant en établissements de santé publics ou privés infectés par le coronavirus Sars-CoV-2.

Mis à jour le 28 janvier 2022

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Face à l’épidémie de COVID-19, les professionnels travaillant en établissements de santé sont une population particulièrement exposée. Il est donc important de les suivre dans le cadre de la surveillance mise en place par Santé publique France. Par ailleurs, les  données actuellement disponibles au niveau national sont parcellaires et hétérogènes. C’est pourquoi, Santé publique France en partenariat avec le Geres (Groupe d'étude sur le risque d'exposition des soignants aux agents infectieux) et avec l’appui des CPias (Centre d’appui pour la prévention des infections associées aux soins), des équipes opérationnelles d'hygiène et de la médecine du travail ont élaboré un protocole de surveillance des professionnels salariés d’établissements de santé publics ou privés. En parallèle, le Geres a lancé sur son site internet un outil de recueil d’informations plus qualitatives, destiné à tous les professionnels de santé atteints par le coronavirus SARS-CoV-2, quels que soient leur profession et leur lieu d’exercice. 

Objectif

L’objectif de cette surveillance est de recenser le nombre de ces professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020. 

Qui est concerné ?

Tous les établissements de santé d’hospitalisation publics et privés. 
Les informations recueillies concernent tous les professionnels salariés de ces établissements : professionnels de santé et autres salariés (personnels d'entretien, personnels administratif…).

Définition de cas

La définition de cas PES/COVID19 retenue pour l’enquête, est la suivante depuis le 9 novembre 2020 :

  • tout professionnel en établissement de santé (ES), symptomatique ou non, avec un résultat biologique confirmant l'infection par le SARS-CoV-2, par RT-PCR, ou par sérologie dans le cadre d'un diagnostic de rattrapage, conformément aux recommandations de la HAS, ou par un test antigénique (TROD ou TDR)
  • tout professionnel en établissement de santé probablement infecté par SARS-CoV-2, (clinique, historique de contact ou imageries évocatrices), reconnu comme infecté par la cellule « covid19» ou le référent infectiologue de l'ES.

Concernant les décès, il s'agit de décès liés à Covid-19.

Qui remplit le questionnaire ?

Une personne référente au sein de l’établissement (service de ressources humaines, médecine du travail, équipe opérationnelle d’hygiène…) est désignée pour remplir le questionnaire chaque semaine. Les données recueillies sont le nombre de professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 dans la semaine précédente, ventilé par catégorie professionnelle pour les soignants, ainsi que les décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 rapportés parmi les professionnels infectés. 

Résultats clés au 25 janvier 2022

Mise en place le 22 avril 2020, cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salariés d’un établissement de santé (PES) d’hospitalisation, public ou privé, ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020.  Ces données sont déclarées chaque semaine par un référent de chaque établissement, et susceptibles d’être corrigées a posteriori au cours de la période de surveillance. 

  • 1 454 des 3 636 établissements de santé en France ont participé au moins une fois à l’enquête. Les établissements participants regroupent 944 808 professionnels salariés, ce qui correspond à 74,3% des PES salariés en France. La participation variait au cours du temps, elle était en moyenne de 600 établissements chaque semaine entre le 13 avril et le 28 juin 2020, de 300 établissements chaque semaine entre le 29 juin 2020 et le 30 mai 2021, puis d’environ 140 établissements chaque semaine depuis juillet 2021. Entre le 6 décembre 2021 et le 25 janvier 2022, la participation était en moyenne de 159 établissements chaque semaine.
  • Depuis le 18 janvier 2022, 5 635 cas supplémentaires ont été déclarés, portant à 105 843 le nombre de professionnels en établissement de santé (PES) infectés pour la période du 1er mars 2020 au 25 janvier 2022. La répartition actualisée du nombre hebdomadaire de cas déclarés montre une augmentation à partir de la semaine S45-2021 pour atteindre 4 764 cas à la semaine S01-2022. Les données de la semaine S03-2022 ne sont pas consolidées.
  • Aucun décès supplémentaire lié à la COVID-19 n’a été déclaré depuis le dernier bilan. Au total, 19 décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 ont été enregistrés depuis le 1er mars 2020, survenus chez 5 médecins, 5 aides-soignants, 1 infirmier, 2 professionnels de santé classés « autres » et 6 professionnels non soignants. Parmi les décès déclarés, aucun n’est survenu depuis mi-décembre 2020.
  • Parmi les 105 843 cas, 67 244 (64%) étaient des professionnels de santé et 11 079 (10%) des professionnels non soignants. Pour 26% des cas, la catégorie professionnelle n’était pas renseignée.
  • Les 2 professions le plus souvent rapportées sont les infirmiers (N=23 167, 22% des cas) et les aides-soignants (N= 19 635, 19% des cas). 
  • Les aides-soignants et les kinésithérapeutes ont été les professions les plus impactées: 11,8% des aides-soignants et 11,4% des kinésithérapeutes exerçant dans les établissements de santé ayant participé à l’enquête depuis le 1er mars 2020, ont été infectés par le SARS-CoV-2.
  • Au cours de la 5ème vague de l’épidémie (à partir de la S45-2021), sur les 294 établissements participant à l’enquête, la catégorie professionnelle « autres professionnels de santé » (Technicien de laboratoire, cadre de santé des services médicotechniques…) apparait comme la catégorie professionnelle la plus contaminée avec une proportion de contamination égale à 4%, suivie par les kinésithérapeutes (3,9%), les infirmiers (3,6%) et les aides-soignants (3,3%).
  • Parmi les 51 712 cas pour lesquels le service d’exercice pendant les 2 semaines précédant l’infection a été renseigné, la majorité avait travaillé dans les services MCO (N=22 966, 44,4%), les services médicotechniques (N= 11 174, 21,6%) ou les services de SSR/SLD (8 017, 15,5%). 15% des PES avaient travaillé dans d’autres types de services.
  • Au cours de la 5ème vague (à partir de la S45-2021), les régions les plus impactées par la pandémie sont l’Ile de France (9,8%), suivi par la région Occitanie (7,2%) et la région Normandie (6,7%).
Figure 1. Nombre de PES atteints de COVID-19 déclarés dans les établissements de santé, par semaine et nombre d’établissements de santé participants, depuis le 20 juillet 2020 (N=72 147), France (données au 25 janvier 2022)
Figure 1. Nombre de PES atteints de COVID-19 déclarés dans les établissements de santé, par semaine et nombre d’établissements de santé participants, depuis le 20 juillet 2020 (N=72 147), France (données au 25 janvier 2022)

Tableau 1. Nombre et proportion de PES-COVID-19 infectés, par catégorie professionnelle, parmi les PES des ES participant depuis le 1er Mars 2020 (N=102 837, données du 25 janvier 2022), France 

Catégorie professionnelleNombre de cas% parmi les PES
Infirmier23 1679,0
Aide-soignant19 63511,8
Médecin6 2366,9
Interne2 6148,0
Kinésithérapeute86711,4
Sage-femme6194,8
Autre professionnel soignant11 1008,6
Autre professionnel non soignant11 0794,5
Inconnu27 520NA
Total102 83710,9

*Source de données pour le nombre total de professionnels par catégorie professionnelle par région : SAE, données 2019 https://www.sae-diffusion.sante.gouv.fr/sae-diffusion/accueil.htm 

Nb1 : Les cas survenus parmi la catégorie professionnelle « élèves » (N= 3 006) n’ont pas été pris en compte dans cette analyse, en l’absence de dénominateur connu.
Nb2 : Le nombre d’inconnus dans le tableau ci-dessus (N= 27 520) est expliqué par le fait que la catégorie professionnelle est une variable optionnelle qui n’est pas remplie par tous les ES participants.

Tableau 2. Répartition par service des PES déclarés infectés par le SARS-CoV-2, depuis le 13 avril 2020 (données au 25 janvier 2022, N=81 432), France

ServiceNombre de PES infectés%
Médecine hors réanimation17 62821,6
Chirurgie4 0925,0
Obstétrique1 2461,5
Réanimation1 7752,2
Soins de suite et réadaptation4 7935,9
Soins de longue durée3 2244,0
Médico-technique11 17413,7
Autre7 7809,6
Inconnu29 72036,5
Total81 432100,0

Nb : Le nombre d’inconnus dans le tableau ci-dessus (N= 29 720) est expliqué par le fait que le type de service est une variable optionnelle qui n’est pas remplie par tous les ES participants.

Source de données pour le nombre total de professionnels par catégorie professionnelle par région : SAE, données 2019 https://www.sae-diffusion.sante.gouv.fr/sae-diffusion/accueil.htm  

SSR : soins de suite et réadaptation
SLD : soins de longue durée

Figure 2. Répartition régionale des proportions de professionnels travaillant en établissements de santé infectés pendant la cinquième vague de la pandémie COVID-19, France (données au 25 Janvier 2022, N=17 337)
Figure 2. Répartition régionale des proportions de professionnels travaillant en établissements de santé infectés pendant la cinquième vague de la pandémie COVID-19, France (données au 25 Janvier 2022, N=17 337)

Discussion

Cette surveillance spécifique permet de suivre le nombre et la proportion de professionnels travaillant en établissements de santé, ayant été infectés par le SARS-Cov2 au cours du temps depuis le début de la pandémie de COVID-19. Elle rapporte que 105 843 professionnels ont été infectés depuis le début de la pandémie dans les établissements de santé participants. 

  • Augmentation du nombre de cas déclarés a été observée à partir de la semaine S45-2021 ; cette augmentation est particulièrement importante depuis la semaine 51-2021, en lien avec la diffusion rapide du variant Omicron et la dynamique observée en communauté.
  • A la semaine S01-2022, le nombre de cas a atteint 4 764, ce qui correspond au plus grand nombre de cas enregistré chez les PES pour une seule semaine, depuis le début de l’épidémie. La participation des établissements de santé a par contre beaucoup varié au cours du temps et ne permet pas une comparaison directe du nombre de cas recensés lors des différentes vagues. Parmi les 1 454 ES qui ont participé à l’enquête depuis le 1er mars 2020, environ 150 ES y participent actuellement régulièrement.
  • Depuis le début de l’épidémie, les infirmiers et les aides-soignants sont les professions le plus souvent atteintes. Relativement à l’ensemble des professionnels de leur catégorie parmi les ES participants, les aides-soignants et les kinésithérapeutes sont les professions les plus impactées depuis le début de l’épidémie (respectivement 11,8% et 11,4%).
  • Depuis la semaine S45-2021, les régions Ile de France, Occitanie et Normandie apparaissent comme les régions les plus impactées par la Covid-19 chez les PES.

Il est crucial de maintenir cette surveillance, de rappeler l’importance des gestes barrières en ES et de continuer à promouvoir la vaccination de cette population particulièrement exposée à l’infection au SARS-COV2. En effet, au 25 janvier 2022, la couverture vaccinale des PES ayant reçu au moins une dose est estimée à 93,7%. La couverture vaccinale des PES pour la vaccination complète est estimée à 93,1% et la couverture vaccinale du rappel est estimée à 68,2% (Données de CV issues de Vaccin COVID).

Par ailleurs, dans le cadre du lancement de la campagne de vaccination contre la grippe saisonnière et la campagne de rappel de vaccination contre la COVID-19, une enquête est mise en œuvre par Santé publique France afin d’évaluer les couvertures vaccinales contre la grippe et la COVID-19 chez les professionnels exerçant en établissements de santé. Le 1er point de mesure de cette enquête a eu lieu du 17 novembre au 1er décembre 2021 et les résultats sont disponibles sur le site internet de Santé publique France. Le deuxième point de mesure est prévu du 1er au 14 mars 2022.