Recensement national des cas de COVID-19 chez les professionnels en établissements de santé

Depuis le 22 avril 2020, Santé publique France en lien avec le GERES et avec l’appui des CPIAS a mis en place une surveillance afin de recenser les professionnels exerçant en établissements de santé publics ou privés infectés par le coronavirus Sars-CoV-2.

Mis à jour le 8 septembre 2022

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Face à l’épidémie de COVID-19, les professionnels travaillant en établissements de santé sont une population particulièrement exposée. Il est donc important de les suivre dans le cadre de la surveillance mise en place par Santé publique France. Par ailleurs, les  données actuellement disponibles au niveau national sont parcellaires et hétérogènes. C’est pourquoi, Santé publique France en partenariat avec le Geres (Groupe d'étude sur le risque d'exposition des soignants aux agents infectieux) et avec l’appui des CPias (Centre d’appui pour la prévention des infections associées aux soins), des équipes opérationnelles d'hygiène et de la médecine du travail ont élaboré un protocole de surveillance des professionnels salariés d’établissements de santé publics ou privés. En parallèle, le Geres a lancé sur son site internet un outil de recueil d’informations plus qualitatives, destiné à tous les professionnels de santé atteints par le coronavirus SARS-CoV-2, quels que soient leur profession et leur lieu d’exercice. 

Objectif

L’objectif de cette surveillance est de recenser le nombre de ces professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020. 

Qui est concerné ?

Tous les établissements de santé d’hospitalisation publics et privés. 
Les informations recueillies concernent tous les professionnels salariés de ces établissements : professionnels de santé et autres salariés (personnels d'entretien, personnels administratif…).

Définition de cas

La définition de cas PES/COVID19 retenue pour l’enquête, est la suivante depuis le 9 novembre 2020 :

  • tout professionnel en établissement de santé (ES), symptomatique ou non, avec un résultat biologique confirmant l'infection par le SARS-CoV-2, par RT-PCR, ou par sérologie dans le cadre d'un diagnostic de rattrapage, conformément aux recommandations de la HAS, ou par un test antigénique (TROD ou TDR)
  • tout professionnel en établissement de santé probablement infecté par SARS-CoV-2, (clinique, historique de contact ou imageries évocatrices), reconnu comme infecté par la cellule « covid19» ou le référent infectiologue de l'ES.

Concernant les décès, il s'agit de décès liés à Covid-19.

Qui remplit le questionnaire ?

Une personne référente au sein de l’établissement (service de ressources humaines, médecine du travail, équipe opérationnelle d’hygiène…) est désignée pour remplir le questionnaire chaque semaine. Les données recueillies sont le nombre de professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 dans la semaine précédente, ventilé par catégorie professionnelle pour les soignants, ainsi que les décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 rapportés parmi les professionnels infectés. 

Résultats clés au 6 septembre 2022

Mise en place le 22 avril 2020, cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salariés d’un établissement de santé (PES) d’hospitalisation, public ou privé, ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020. Ces données sont déclarées chaque semaine par un référent de chaque établissement, et susceptibles d’être corrigées a posteriori au cours de la période de surveillance. 

 

  • 1 395 des 3 636 établissements de santé en France ont participé au moins une fois à l’enquête. Les établissements participants regroupent 951 002 professionnels salariés, ce qui correspond à 74,8% des PES salariés en France. La participation variait au cours du temps, elle était en moyenne de 390 établissements chaque semaine entre le 13 avril et le 31 décembre 2020, de 200 établissements chaque semaine en 2021, puis d’environ 160 établissements chaque semaine depuis janvier 2022 (Figure 1). Aucun ES appartenant aux régions d’Outre-Mer n’a participé à l’enquête pendant ces dernières semaines.
  • Depuis le 16 août 2022, 775 contaminations supplémentaires liées à la Covid-19 ont été déclarées chez les PES, portant à 148 200 le nombre de contaminations chez les PES pour la période du 1er mars 2020 au 06 septembre 2022. La répartition actualisée du nombre hebdomadaire de cas déclarés montre une diminution à partir de la semaine S28-2022. Les données de la semaine S35-2022 ne sont pas consolidées (Figure 1).
  • Aucun décès supplémentaire lié à la COVID-19 n’a été déclaré depuis le dernier bilan. Au total, 19 décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 ont été enregistrés depuis le 1er mars 2020, survenus chez 5 médecins, 5 aides-soignants, 1 infirmier, 2 professionnels de santé classés « autres » et 6 professionnels non soignants. Parmi les décès déclarés, aucun n’est survenu depuis mi-décembre 2020.
  • Parmi les 148 200 cas, 91 581 (62%) étaient des professionnels soignants et 17 362 (12%) des professionnels non soignants. Pour 26% des cas, la catégorie professionnelle n’était pas renseignée.
  • Les 2 professions le plus souvent rapportées étaient les infirmiers (N=32 813, 22,1% des cas) et les aides-soignants (N=25 745, 17,4% des cas).
  • Parmi les 80 958 cas pour lesquels le service d’exercice pendant les 2 semaines précédant l’infection a été renseigné, la majorité avait travaillé dans les services Médecine, Chirurgie, Obstétrique (MCO) (N=32 507, 40,2%), les services médicotechniques (N= 24 302, 30%) ou les services de Soins de suite et réadaptation / Soins de longue durée (SSR/SLD) (11 821, 14,6%). 12,4% des PES avaient travaillé dans d’autres types de services.
Figure 1. Nombre de PES atteints de COVID-19 déclarés dans les ES, par semaine et nombre d’ES participants, depuis le 20 juillet 2020 (N=114 603), France (données au 06 septembre 2022)
Figure 1. Nombre de PES atteints de COVID-19 déclarés dans les ES, par semaine et nombre d’ES participants, depuis le 20 juillet 2020 (N=114 603), France (données au 06 septembre 2022)

Tableau 1. Répartition par service des PES déclarés infectés par le SARS-CoV-2, depuis le 13 avril 2020 (données au 6 septembre 2022, N=123 815), France.

ServiceNombre de PES infectés%
Médecine 24 15919,5
Chirurgie6 2995,1
Obstétrique2 0491,7
Réanimation2 3091,9
Soins de suite et réadaptation6 7305,4
Soins de longue durée5 0914,1
Médico-technique24 30219,6
Autre10 0198,1
Inconnu42 85734,6
Total123 815100,0

Nb : Le nombre d’inconnus dans le tableau ci-dessus (N=42 857) est expliqué par le fait que le type de service est une variable optionnelle qui n’est pas remplie par tous les ES participants.

Source de données pour le nombre total de professionnels par catégorie professionnelle par région : SAE, données 2019 https://www.sae-diffusion.sante.gouv.fr/sae-diffusion/accueil.htm  

Discussion

Cette surveillance spécifique permet de suivre le nombre et la proportion de professionnels travaillant en établissements de santé, ayant été infectés par le SARS-Cov2 depuis le début de la pandémie de COVID-19. Elle rapporte que 148 200 PES ont été infectés dans les ES participants. La courbe épidémique montre une diminution du nombre de cas à partir de la S28-2022. Cette évolution est cohérente avec la dynamique de la pandémie en population générale.

La participation des ES a beaucoup varié au cours du temps et ne permet pas une comparaison directe du nombre de cas recensés lors des différentes vagues. Parmi les 1 395 ES qui ont participé à l’enquête depuis le 1er mars 2020, environ 150 ES y participent actuellement régulièrement. Le nombre d’ES participant diminue depuis la semaine S04-2022.

Depuis le début de l’épidémie, les infirmiers et les aides-soignants sont les professions le plus souvent atteintes. La majorité des PES infectés par la Covid-19 avait travaillé dans les services de MCO et les services médicotechniques.

Il est crucial de maintenir cette surveillance, de rappeler l’importance des gestes barrières en ES et de continuer à promouvoir la vaccination de cette population particulièrement exposée à l’infection au SARS-COV2. En effet, au 06 septembre 2022, la couverture vaccinale des PES ayant reçu au moins une dose est estimée à 94,5%. La couverture vaccinale des PES pour la vaccination complète est estimée à 94,1% et la couverture vaccinale du rappel est estimée à 79,3%. (Données de CV issues de Vaccin COVID, analyses Santé publique France).

Par ailleurs, dans le cadre de la campagne de vaccination contre la grippe saisonnière et la campagne de rappel de vaccination contre la Covid-19, deux enquêtes ont été mises en œuvre par Santé publique France afin d’évaluer les couvertures vaccinales contre la grippe et la COVID-19 chez les professionnels exerçant en établissements de santé. Le 1er point de mesure a eu lieu du 17 novembre au 1er décembre 2021 et les résultats sont disponibles sur le site internet de Santé publique France. Le deuxième point de mesure s’est déroulé du 1er au 15 mars 2022 (informations disponibles sur le site internet de Santé publique France).