La ville de Besançon donne la priorité au contrôle de la salubrité des logements. Ainsi, elle alerte le préfet par un rapport d'enquête lorsqu'il y a mise en danger des occupants (locataires ou propriétaires). Parallèlement, elle mène une opération de réhabilitation de l'habitat ancien dégradé du coeur de ville et contrôle les locations en centre-ville pour dissuader les bailleurs de louer des logements indécents ou insalubres.