Brochure présentant le projet SEQ4EPI et ses résultats après trois ans d'existence. Cofinancé par l'Union européenne, ce projet est porté par Santé publique France et le Centre national de référence des virus des infections respiratoires (CNR-VIR). Il vise à renforcer la surveillance des maladies infectieuses en France grâce au séquençage des pathogènes et à répondre de manière réactive aux potentielles futures crises sanitaires. Lancé en octobre 2022 pour trois ans, SEQ4EPI s'appuie sur un réseau de laboratoires et d'institutions. Le projet s'inscrit dans la continuité du consortium EMERGEN, créé en 2021 pour répondre à la crise COVID-19, et s'étend à d'autres pathogènes émergents, tels que le virus Monkeypox et les virus Influenza. Entre janvier 2022 et juillet 2024, SEQ4EPI a consolidé la surveillance génomique du SARS-CoV-2, réalisant 135 enquêtes de prévalence pour suivre la diffusion des variants. Les données recueillies ont été utilisées dans plusieurs publications scientifiques et bulletins épidémiologiques de Santé publique France. SEQ4EPI soutient également le développement d'outils bio-informatiques, tels que le clusterfinder et le SARSProbeMonitor, pour l'identification de clusters et l'évaluation des mutations affectant la détection du SARS-CoV-2. Le projet inclut également un inventaire des capacités et besoins de séquençage des CNR français. Pour plus d'informations, la brochure renvoie aux pages web en français et en anglais de Santé publique France et fournit des liens vers les partenaires et projets européens associés.