Points clés

COVID-19

Les phénomènes de recombinaison entre deux variants différents du SARS-CoV-2 représentent des évènements de divergence génétique majeurs. Depuis le 18/02/2022, un recombinant Delta/Omicron (auquel aucun nom de lignage n’a encore été assigné) fait l’objet d’un suivi renforcé par Santé publique France et le CNR Virus des infections respiratoires. La majorité de son génome correspond au variant Delta (sous-lignage AY.4), mais une large portion du gène S (codant pour la protéine Spike) correspond au variant Omicron (sous-lignage BA.1). Au 02/03, 18 séquences de ce recombinant ont été détectées en France.

Grippe et syndrome grippal

La région est en phase épidémique depuis 11 semaines. Après une augmentation fin décembre, les indicateurs ont diminué début janvier pour se stabiliser à un niveau élevé. Les enfants de moins de 15 ans sont toujours particulièrement concernés.

Gastro-entérite aiguë

• En médecine hospitalière, selon les données transmises par les structures d’urgence au réseau Oscour®, l’activité de la gastro-entérite était élevée en semaine 08-2022. La part des recours tous âges et chez les moins de 5 ans pour diagnostic de gastro-entérite étaient stables par rapport à la semaine précédente mais les effectifs de passage en diminution. En semaine 08-2022, 645 passages pour gastro-entérite ont été relevés (dont 446 pour des patients âgés de moins de 5 ans) soit 2,3% des passages (versus 692 passages en semaine 07).

• En médecine libérale, d’après les données des associations SOS Médecins de Nîmes, Montpellier et Perpignan (SOS Toulouse exclu des analyses en raison de données manquantes depuis le 16/02), l’activité de la gastro-entérite était modérée en semaine 08-2022. Les actes tous âges et chez les moins de 5 ans pour diagnostic de gastro-entérite étaient en diminution par rapport à la semaine précédente. En semaine 08-2022, 161 actes pour ce diagnostic ont été relevés soit 7,5% de l’activité globale des associations SOS Médecins (versus 210 actes en semaine 07).