L'émergence de la Covid-19 a confronté l'ensemble des pays à de nombreux défis, tant sanitaires qu'économiques, sociétaux et politiques. L'un d'entre eux a été le déploiement rapide d'un système de surveillance multi-sources réactif, adaptable au cours du temps, permettant de produire les indicateurs épidémiologiques nécessaires à la gestion de l'épidémie. Cet article décrit la construction du système de surveillance de la Covid-19 en France par Santé publique France et ses partenaires à partir du mois de janvier 2020 et son évolution au cours de la pandémie. La progression rapide des connaissances sur le SARS-CoV-2, en particulier sur sa transmission, l'infection qu'il provoque, les populations qu'il affecte le plus et les différents facteurs de risque de maladie, d'hospitalisation ou de décès, a rendu le défi d'autant plus grand, nécessitant une adaptation continue des modalités de surveillance et des mesures de prévention contre la diffusion du virus.