Développement d'une toolbox (boîte à outils) QGIS pour l'investigation et le suivi des épidémies d'arboviroses.

Référence de l'apprentissage : DATA-STA-2023-06

Publié le 17 novembre 2023
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Présentation de l'agenceAfficherMasquer

Santé publique France est l’agence nationale de santé publique française. Etablissement public de l’Etat sous tutelle du ministre chargé de la santé créé par l’ordonnance 2016-246 du 15 avril 2016, elle intervient au service de la santé des populations. Agence scientifique et d’expertise du champ sanitaire, elle a pour missions :

  1. L'observation épidémiologique et la surveillance de l'état de santé des populations ;
  2. La veille sur les risques sanitaires menaçant les populations ;
  3. La promotion de la santé et la réduction des risques pour la santé ;
  4. Le développement de la prévention et de l'éducation pour la santé ;
  5. La préparation et la réponse aux menaces, alertes et crises sanitaires ;
  6. Le lancement de l'alerte sanitaire.

L’agence est organisée autour de directions scientifiques et transversales et de directions assurant le support et le soutien à l’activité.
Son programme de travail, arrêté par son Conseil d’administration, s’articule autour de cinq axes prioritaires : les déterminants de santé, les populations, les pathologies, les interventions et les territoires, et les infrastructures.

AffectationAfficherMasquer

Développement d'une toolbox (boîte à outils) QGIS pour l'investigation et le suivi des épidémies d'arboviroses.

Description du stageAfficherMasquer

Missions

En lien avec l’équipe géomatique de la DATA, le stagiaire aura pour mission de : 

  • Identifier l’ensemble des fonctionnalités à implémenter dans la toolbox, ainsi que les données d’intérêt à charger et maintenir à jour pour répondre au besoin des épidémiologistes en région. Cette étape sera réalisée en lien avec la cellule régionale de Guyane, mais pourra être aussi être envisagée après échanges avec d’autres cellules régionales de Santé publique France récemment confrontées à ce sujet.
  • Développer une boite à outil (Toolbox) QGIS via PyQGIS qui permettra de géolocaliser, identifier et investiguer des clusters de cas de Dengue (ou autre maladie vectorielle), en implémentant les fonctionnalités inventoriées dans un premier temps.
  • Accompagner cet outil d’une documentation pour en permettre l’usage par un utilisateur non familier de la donnée géographique. La maintenance, l’enrichissement et la reproductibilité devra également être explicité dans le document pour permettre des mises en pratiques similaires par les géomaticiens. Pour ce faire, l’utilisation de github / gitlab est souhaitée.

Activités

  • Appropriation du sujet et échanges avec le métier (les épidémiologistes en région) pour définir le besoin
  • Production d’une première maquette ou d’un logigramme méthodologique
  • Développement de la Toolbox QGIS
  • Rédaction de la documentation de l’outil (github souhaité)