Détection automatisée d'agrégats de cas de gastro-entérites aiguës dans trois départements, France, 2009-2012. Utilisation pour la prévention des épidémies d'origine hydrique

Publié le 1 Janvier 2014
Mis à jour le 10 septembre 2019

Une étude pilote a été menée pour appréhender le potentiel des données de remboursement des médicaments de l'Assurance Maladie pour l'identification automatisée (clustering) des épidémies d'origine hydrique. Le nombre hebdomadaire de cas de gastroentérite aiguë médicalisée (GEAm) a été dérivé de cette base de données pour les 1 543 communes de 3 départements français à dominante rurale sur la période 2009-2012. Une méthode de clustering, combinant 2 méthodes simples, a été fondée sur la comparaison spatiale des taux d'incidence (méthode A) et sur la comparaison spatiale de l'évolution temporelle de ces taux d'incidence (méthode B) entre la commune ciblée et les communes du département. Pour chaque département, chaque commune a été testée, semaine par semaine, sur toute la période d'étude. Deux cent dix agrégats hebdomadaires impliquant plus de 5 cas de GEAm ont été identifiés par cette méthode à partir de critères de détection tirés de la pratique des investigations de terrain. Ces agrégats forment 193 agrégats consolidés de 1 à 3 semaines. Une commune sur dix a éprouvé un agrégat et moins de 2 sur 100 plusieurs. L'inférence à la France entière indique que 1 000 agrégats (soit 30 000 cas de GEAm au total) pourraient être détectés annuellement. L'impact représenté par les agrégats ne comprend qu'une faible part du total des cas de GEAm d'origine hydrique. Plus que de renseigner l'impact infectieux de l'eau, l'objectif de ce clustering est de stimuler les investigations de terrain, les orienter vers les situations les plus à risque en coordination avec la mise en place des Water Safety Plans, et alimenter la surveillance des facteurs de risque au niveau national. Cette méthode apparaît perfectible. Une inter-comparaison avec d'autres méthodes doit être menée par ailleurs, avant le choix définitif de la méthode qu'il conviendra de mettre en oeuvre au niveau national. (R.A.)

Auteur : Rambaud L, Galey C, Guillet A, Corso M, van Cauteren D, Beaudeau P
Année de publication : 2014
Pages : 34 p.