Recensement national des cas de COVID-19 chez les professionnels en établissements de santé

Depuis le 22 avril 2020, Santé publique France en lien avec le GERES et avec l’appui des CPIAS a mis en place une surveillance afin de recenser les professionnels exerçant en établissements de santé publics ou privés infectés par le coronavirus Sars-CoV-2.

Mis à jour le 18 novembre 2021

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Face à l’épidémie de COVID-19, les professionnels travaillant en établissements de santé sont une population particulièrement exposée. Il est donc important de les suivre dans le cadre de la surveillance mise en place par Santé publique France. Par ailleurs, les  données actuellement disponibles au niveau national sont parcellaires et hétérogènes. C’est pourquoi, Santé publique France en partenariat avec le Geres (Groupe d'étude sur le risque d'exposition des soignants aux agents infectieux) et avec l’appui des CPias (Centre d’appui pour la prévention des infections associées aux soins), des équipes opérationnelles d'hygiène et de la médecine du travail ont élaboré un protocole de surveillance des professionnels salariés d’établissements de santé publics ou privés. En parallèle, le Geres a lancé sur son site internet un outil de recueil d’informations plus qualitatives, destiné à tous les professionnels de santé atteints par le coronavirus SARS-CoV-2, quels que soient leur profession et leur lieu d’exercice. 

Objectif

L’objectif de cette surveillance est de recenser le nombre de ces professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020. 

Qui est concerné ?

Tous les établissements de santé d’hospitalisation publics et privés. 
Les informations recueillies concernent tous les professionnels salariés de ces établissements : professionnels de santé et autres salariés (personnels d'entretien, personnels administratif…).

Définition de cas

La définition de cas PES/COVID19 retenue pour l’enquête, est la suivante depuis le 9 novembre 2020 :

  • tout professionnel en établissement de santé (ES), symptomatique ou non, avec un résultat biologique confirmant l'infection par le SARS-CoV-2, par RT-PCR, ou par sérologie dans le cadre d'un diagnostic de rattrapage, conformément aux recommandations de la HAS, ou par un test antigénique (TROD ou TDR)
  • tout professionnel en établissement de santé probablement infecté par SARS-CoV-2, (clinique, historique de contact ou imageries évocatrices), reconnu comme infecté par la cellule « covid19» ou le référent infectiologue de l'ES.

Concernant les décès, il s'agit de décès liés à Covid-19.

Qui remplit le questionnaire ?

Une personne référente au sein de l’établissement (service de ressources humaines, médecine du travail, équipe opérationnelle d’hygiène…) est désignée pour remplir le questionnaire chaque semaine. Les données recueillies sont le nombre de professionnels ayant été infectés par le SARS-CoV-2 dans la semaine précédente, ventilé par catégorie professionnelle pour les soignants, ainsi que les décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 rapportés parmi les professionnels infectés. 

Résultats clés

Mise en place le 22 avril 2020, cette surveillance a pour objectif de recenser les professionnels salariés d’un établissement de santé d’hospitalisation, public ou privé, ayant été infectés par le SARS-CoV-2 depuis le 1er mars 2020. Ces données sont déclarées chaque semaine par un référent de chaque établissement, et susceptibles d’être corrigées a posteriori au cours de la période de surveillance. 

  • 1401 des 3 636 établissements de santé en France ont participé au moins une fois à l’enquête. Les établissements participants regroupent 936 619 professionnels salariés, ce qui correspond à 73,6 % des PES salariés en France. La participation variait au cours du temps, elle était en moyenne de 600 établissements chaque semaine entre le 13 avril et le 28 juin 2020, puis autour de 300 établissements ont participé chaque semaine entre le 29 juin et le 30 mai 2021, et diminuait pour atteindre environ 130 établissements chaque semaine depuis juillet 2021.
  • Depuis le 22 septembre 2021, 557 cas supplémentaires ont été déclarés, portant à 88 204 le nombre de professionnels en établissement de santé (PES) infectés pour la période du 1er mars 2020 au 02 novembre 2021. La répartition actualisée du nombre hebdomadaire de cas déclarés montre, une légère augmentation à partir de la semaine S28-2021 et jusqu’à la semaine S37-2021, suivie d’une diminution à partir de la semaine S38-2021. Les données de la semaine 43 ne sont pas consolidées (Figure 1).
  • Aucun décès supplémentaire lié à la COVID-19 n’a été déclaré depuis le dernier bilan. Au total, 19 décès liés à l’infection à SARS-CoV-2 ont été enregistrés depuis le 1er mars 2020, survenus chez 5 médecins, 5 aides-soignants, 1 infirmier, 2 professionnels de santé classés « autres » et 6 professionnels non soignants. Parmi les décès déclarés, aucun n’est survenu depuis mi-décembre 2020.
  • Parmi les 88 204 cas, 60 704 (69%) étaient des professionnels de santé et 9 500 (11%) des professionnels non soignants. Pour 20 % des cas, la catégorie professionnelle n’était pas renseignée.
  • Les 2 professions le plus souvent rapportées sont les infirmiers (N=20 677, 23% des cas) et les aides-soignants (N= 18 055, 20% des cas). 
  • Les aides-soignants et les kinésithérapeutes ont été les professions les plus impactées: 10,9% des aides-soignants et 10,5% des kinésithérapeutes exerçant dans les établissements de santé ayant participé à l’enquête depuis le 1er mars 2020, ont été infectés par le SARS-CoV2.
  • Parmi les 43 937 cas pour lesquels le service d’exercice pendant les 2 semaines précédant l’infection a été renseigné, la majorité avait travaillé dans les services MCO (N=20 364, 46,3%), les services médicotechniques (N= 7 765, 17,7%) ou les services de SSR/SLD (6 974, 16%). 20% des PES avaient travaillé dans d’autres types de services.
  • La répartition géographique de la proportion de PES infectés (Figure 2), montre que, lors de la deuxième, la troisième et la quatrième vague, les contaminations apparaissent homogènes pour les différentes régions. La Guyane est la région la plus impactée lors de la quatrième vague où on enregistre une proportion de PES contaminée égale à 7,8%.
Nombre de PES atteints de COVID-19 déclarés dans les établissements de santé, par semaine, depuis le 20/07/20 (N=54 078), France (données au 18/11/21)
Nombre de professionnels en établissements de santé atteints de COVID-19 déclarés dans les établissements de santé, par semaine, depuis le 20/07/20 (N=54 078), France (données au 18/11/21)

Nombre et proportion de professionnels de santé (PES)-COVID-19 infectés, par catégorie professionnelle, parmi les PES des ES participant depuis le 01/03/20 (données au 02/11/21), France

Catégorie professionnelleNombre de cas% parmi les PES
Infirmier20 6778,1
Aide-soignant18 05510,9
Médecin5 7306,4
Interne2 3967,3
Kinésithérapeute79610,5
Sage-femme5384,2
Autre professionnel soignant9 7587,6
Autre professionnel non soignant9 5003,9
Inconnu18 000NA
Total85 4509,1

*Source de données pour le nombre total de professionnels par catégorie professionnelle par région : SAE, données 2019 https://www.sae-diffusion.sante.gouv.fr/sae-diffusion/accueil.htm 
Nb : Les cas survenus parmi la catégorie professionnelle « élèves » (N= 2 754) n’ont pas été pris en compte dans cette analyse, en l’absence de dénominateur connu.

Répartition par service des professionnels de santé déclarés infectés par le SARS-CoV-2, depuis le 13/04/20 (données au 02/11/21, N=63 846), France

ServiceNombre de PES infectés%
Médecine hors réanimation15 80524,8
Chirurgie3 5245,5
Obstétrique1 0351,6
Réanimation1 5872,5
Soins de suite et réadaptation4 1196,5
Soins de longue durée2 8554,5
Médico-technique7 76512,2
Autre7 24711,4
Inconnu19 90931,2
Total63 846100,0

 

Proportions de professionnels travaillant en établissements de santé infectés pendant la deuxième, la troisième et la quatrième vague de la pandémie COVID-19, France

Vague 2
Vague 3
Vague 4

Discussion

Cette surveillance spécifique permet de suivre le nombre et la proportion de professionnels travaillant en établissements de santé, ayant été infectés par le SARS-Cov2 au cours du temps depuis le début de la pandémie de COVID-19. Elle rapporte que 88 204 professionnels ont été infectés depuis le début de la pandémie dans les établissements de santé participants. Une légère augmentation du nombre de cas déclarés a été observée à partir de la semaine S28-2021 et jusqu’à la semaine S37-2021, suivie d’une diminution à partir de la semaine S38-2021. Malgré cette diminution du nombre de cas la poursuite de cette surveillance reste nécessaire dans le contexte d’une reprise de la circulation du virus en communauté. 

Depuis le début de l’épidémie, les infirmiers et les aides-soignants restent les professions le plus souvent atteintes. Relativement à l’ensemble des professionnels de leur catégorie parmi les ES participants, les aides-soignants et les kinésithérapeutes sont les professions les plus impactées depuis de le début de l’épidémie (respectivement 10,9% et 10,5%), 

Lors de la deuxième, la troisième et la quatrième vague, les contaminations apparaissent homogènes pour les différentes régions. La Guyane est la région la plus impactée lors de la quatrième vague. Ces données sont cohérentes avec les indicateurs en population générale.

Le niveau élevé de couverture vaccinale chez les PES a probablement contribué à contenir le nombre de cas observés depuis la 4e vague. Au 02 novembre, la couverture vaccinale des PES était estimée à 91,8% pour au moins une dose, 90,9% pour la vaccination complète et 2,9% pour la dose de rappel (Données Vaccin COVID).

Il est crucial de maintenir les gestes barrières en ES et de continuer à promouvoir la vaccination de cette population particulièrement exposée à l’infection au SARS-COV2.

En effet, dans le cadre du lancement de la compagne de vaccination contre la grippe saisonnière et la compagne de rappel de vaccination contre la Covid-19, une enquête est mise en œuvre par Santé publique France afin d’évaluer les couvertures vaccinales contre la grippe et la COVID-19 chez les professionnels exerçant en établissements de santé. Cette enquête aura lieu en deux temps, le premier point de mesure est prévu du 17 novembre au 1er décembre 2021 et le deuxième du 1er au 15 février 2022.